Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufd1P70362 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ufd1P70362 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufd1P70362 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 298.8 ms