Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgif1P70284 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tgif1P70284 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tgif1P70284 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tgif1P70284 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tgif1P70284 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgif1P70284 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tgif1P70284 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgif1P70284 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgif1P70284 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgif1P70284 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tgif1P70284 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tgif1P70284 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgif1P70284 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgif1P70284 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgif1P70284 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tgif1P70284 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgif1P70284 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgif1P70284 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgif1P70284 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgif1P70284 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tgif1P70284 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgif1P70284 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tgif1P70284 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tgif1P70284 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tgif1P70284 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgif1P70284 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tgif1P70284 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tgif1P70284 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgif1P70284 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgif1P70284 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tgif1P70284 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgif1P70284 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgif1P70284 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgif1P70284 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgif1P70284 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgif1P70284 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms