Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkn1P70268 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pkn1P70268 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkn1P70268 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkn1P70268 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms