Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps17P63276 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps17P63276 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps17P63276 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps17P63276 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps17P63276 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps17P63276 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps17P63276 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps17P63276 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps17P63276 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rps17P63276 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps17P63276 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps17P63276 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps17P63276 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps17P63276 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps17P63276 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps17P63276 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps17P63276 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps17P63276 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps17P63276 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rps17P63276 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rps17P63276 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps17P63276 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps17P63276 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps17P63276 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps17P63276 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps17P63276 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps17P63276 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps17P63276 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps17P63276 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps17P63276 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps17P63276 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps17P63276 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps17P63276 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms