Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl8P62918 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl8P62918 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl8P62918 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl8P62918 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms