Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl31P62900 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpl31P62900 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl31P62900 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms