Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2lP62876 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr2lP62876 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2lP62876 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr2lP62876 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Polr2lP62876 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2lP62876 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2lP62876 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2lP62876 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2lP62876 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms