Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11aP62492 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11aP62492 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11aP62492 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11aP62492 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11aP62492 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms