Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2kP61087 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2kP61087 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2kP61087 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2kP61087 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms