Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ppfia3P60469 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ppfia3P60469 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfia3P60469 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ppfia3P60469 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms