Protein–RNA interactions for Protein: P59481

Lman2l, VIP36-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lman2lP59481 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lman2lP59481 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lman2lP59481 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lman2lP59481 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lman2lP59481 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms