Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Wdhd1P59328 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Wdhd1P59328 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Wdhd1P59328 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Wdhd1P59328 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Wdhd1P59328 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms