Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm1P58771 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tpm1P58771 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm1P58771 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpm1P58771 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms