Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NcstnP57716 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NcstnP57716 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NcstnP57716 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NcstnP57716 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NcstnP57716 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NcstnP57716 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NcstnP57716 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NcstnP57716 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NcstnP57716 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NcstnP57716 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NcstnP57716 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NcstnP57716 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NcstnP57716 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NcstnP57716 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NcstnP57716 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NcstnP57716 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NcstnP57716 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms