Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp25P57080 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp25P57080 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp25P57080 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp25P57080 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp25P57080 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp25P57080 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp25P57080 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp25P57080 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp25P57080 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp25P57080 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp25P57080 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp25P57080 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp25P57080 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp25P57080 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp25P57080 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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