Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SmoP56726 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SmoP56726 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SmoP56726 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SmoP56726 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SmoP56726 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SmoP56726 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SmoP56726 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SmoP56726 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SmoP56726 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SmoP56726 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SmoP56726 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SmoP56726 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SmoP56726 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SmoP56726 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SmoP56726 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SmoP56726 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SmoP56726 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SmoP56726 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SmoP56726 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SmoP56726 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SmoP56726 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SmoP56726 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SmoP56726 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SmoP56726 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SmoP56726 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SmoP56726 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SmoP56726 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SmoP56726 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SmoP56726 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SmoP56726 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SmoP56726 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SmoP56726 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SmoP56726 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SmoP56726 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SmoP56726 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SmoP56726 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SmoP56726 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SmoP56726 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SmoP56726 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SmoP56726 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SmoP56726 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SmoP56726 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SmoP56726 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SmoP56726 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SmoP56726 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SmoP56726 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SmoP56726 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SmoP56726 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SmoP56726 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SmoP56726 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SmoP56726 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SmoP56726 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SmoP56726 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SmoP56726 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmoP56726 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmoP56726 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmoP56726 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmoP56726 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmoP56726 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmoP56726 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmoP56726 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmoP56726 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SmoP56726 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmoP56726 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmoP56726 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmoP56726 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmoP56726 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmoP56726 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmoP56726 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmoP56726 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmoP56726 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SmoP56726 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmoP56726 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmoP56726 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmoP56726 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmoP56726 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SmoP56726 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SmoP56726 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmoP56726 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmoP56726 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SmoP56726 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SmoP56726 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SmoP56726 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SmoP56726 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SmoP56726 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SmoP56726 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SmoP56726 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SmoP56726 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SmoP56726 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SmoP56726 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmoP56726 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmoP56726 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmoP56726 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmoP56726 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SmoP56726 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SmoP56726 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SmoP56726 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SmoP56726 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SmoP56726 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms