Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctbp2P56546 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctbp2P56546 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctbp2P56546 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms