Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd38P56528 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd38P56528 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd38P56528 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd38P56528 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd38P56528 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd38P56528 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd38P56528 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd38P56528 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd38P56528 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms