Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NcanP55066 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NcanP55066 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NcanP55066 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NcanP55066 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NcanP55066 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NcanP55066 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcanP55066 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcanP55066 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcanP55066 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcanP55066 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcanP55066 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NcanP55066 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NcanP55066 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcanP55066 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NcanP55066 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcanP55066 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NcanP55066 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NcanP55066 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NcanP55066 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NcanP55066 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NcanP55066 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NcanP55066 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NcanP55066 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NcanP55066 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NcanP55066 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NcanP55066 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NcanP55066 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NcanP55066 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NcanP55066 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NcanP55066 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NcanP55066 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NcanP55066 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NcanP55066 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NcanP55066 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NcanP55066 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NcanP55066 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NcanP55066 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NcanP55066 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NcanP55066 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NcanP55066 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NcanP55066 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NcanP55066 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NcanP55066 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NcanP55066 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NcanP55066 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NcanP55066 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NcanP55066 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NcanP55066 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NcanP55066 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NcanP55066 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NcanP55066 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NcanP55066 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NcanP55066 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NcanP55066 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NcanP55066 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NcanP55066 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NcanP55066 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NcanP55066 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NcanP55066 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NcanP55066 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NcanP55066 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NcanP55066 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NcanP55066 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NcanP55066 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NcanP55066 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NcanP55066 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NcanP55066 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NcanP55066 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NcanP55066 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NcanP55066 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NcanP55066 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NcanP55066 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NcanP55066 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NcanP55066 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NcanP55066 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NcanP55066 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NcanP55066 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NcanP55066 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NcanP55066 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NcanP55066 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NcanP55066 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NcanP55066 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NcanP55066 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NcanP55066 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NcanP55066 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NcanP55066 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NcanP55066 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NcanP55066 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NcanP55066 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NcanP55066 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NcanP55066 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NcanP55066 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NcanP55066 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NcanP55066 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NcanP55066 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NcanP55066 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NcanP55066 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NcanP55066 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NcanP55066 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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