Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn5P54830 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn5P54830 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn5P54830 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms