Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fdft1P53798 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fdft1P53798 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fdft1P53798 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms