Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

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Length 686 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Epb41l4aP52963 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Epb41l4aP52963 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Epb41l4aP52963 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Epb41l4aP52963 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Epb41l4aP52963 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Epb41l4aP52963 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epb41l4aP52963 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epb41l4aP52963 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epb41l4aP52963 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epb41l4aP52963 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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