Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lbx1P52955 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lbx1P52955 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lbx1P52955 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lbx1P52955 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms