Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube2e3P52483 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2e3P52483 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2e3P52483 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2e3P52483 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms