Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx3P50481 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx3P50481 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lhx3P50481 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lhx3P50481 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms