Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SftpbP50405 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpbP50405 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpbP50405 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpbP50405 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpbP50405 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpbP50405 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpbP50405 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SftpbP50405 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SftpbP50405 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SftpbP50405 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SftpbP50405 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SftpbP50405 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SftpbP50405 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SftpbP50405 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SftpbP50405 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SftpbP50405 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SftpbP50405 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpbP50405 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SftpbP50405 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpbP50405 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SftpbP50405 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpbP50405 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SftpbP50405 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SftpbP50405 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SftpbP50405 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SftpbP50405 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpbP50405 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SftpbP50405 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms