Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nkx2-1P50220 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx2-1P50220 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx2-1P50220 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms