Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdkn1cP49919 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdkn1cP49919 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdkn1cP49919 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdkn1cP49919 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 266.2 ms