Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hcls1P49710 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hcls1P49710 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hcls1P49710 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hcls1P49710 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcls1P49710 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcls1P49710 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcls1P49710 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcls1P49710 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcls1P49710 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcls1P49710 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hcls1P49710 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hcls1P49710 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hcls1P49710 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms