Protein–RNA interactions for Protein: P49698

Hnf4a, Hepatocyte nuclear factor 4-alpha, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnf4aP49698 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hnf4aP49698 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hnf4aP49698 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hnf4aP49698 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hnf4aP49698 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hnf4aP49698 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hnf4aP49698 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hnf4aP49698 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hnf4aP49698 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hnf4aP49698 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hnf4aP49698 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hnf4aP49698 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hnf4aP49698 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hnf4aP49698 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hnf4aP49698 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hnf4aP49698 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hnf4aP49698 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hnf4aP49698 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hnf4aP49698 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hnf4aP49698 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hnf4aP49698 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hnf4aP49698 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms