Protein–RNA interactions for Protein: P49660

Sstr4, Somatostatin receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr4P49660 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sstr4P49660 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sstr4P49660 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sstr4P49660 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sstr4P49660 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sstr4P49660 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sstr4P49660 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sstr4P49660 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sstr4P49660 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sstr4P49660 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sstr4P49660 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sstr4P49660 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sstr4P49660 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sstr4P49660 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sstr4P49660 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sstr4P49660 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms