Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HpdP49429 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HpdP49429 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HpdP49429 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HpdP49429 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HpdP49429 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HpdP49429 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HpdP49429 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HpdP49429 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HpdP49429 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HpdP49429 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HpdP49429 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HpdP49429 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HpdP49429 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HpdP49429 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HpdP49429 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HpdP49429 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HpdP49429 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HpdP49429 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HpdP49429 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HpdP49429 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HpdP49429 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HpdP49429 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HpdP49429 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HpdP49429 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HpdP49429 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HpdP49429 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HpdP49429 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HpdP49429 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HpdP49429 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HpdP49429 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HpdP49429 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HpdP49429 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HpdP49429 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HpdP49429 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HpdP49429 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HpdP49429 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HpdP49429 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HpdP49429 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HpdP49429 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HpdP49429 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HpdP49429 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HpdP49429 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HpdP49429 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HpdP49429 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HpdP49429 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HpdP49429 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HpdP49429 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HpdP49429 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HpdP49429 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HpdP49429 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HpdP49429 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HpdP49429 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HpdP49429 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HpdP49429 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HpdP49429 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HpdP49429 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HpdP49429 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HpdP49429 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HpdP49429 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HpdP49429 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HpdP49429 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HpdP49429 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HpdP49429 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HpdP49429 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HpdP49429 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HpdP49429 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HpdP49429 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HpdP49429 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HpdP49429 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HpdP49429 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HpdP49429 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HpdP49429 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HpdP49429 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HpdP49429 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HpdP49429 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HpdP49429 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HpdP49429 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HpdP49429 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HpdP49429 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HpdP49429 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HpdP49429 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HpdP49429 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HpdP49429 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HpdP49429 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HpdP49429 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HpdP49429 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HpdP49429 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HpdP49429 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HpdP49429 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HpdP49429 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HpdP49429 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HpdP49429 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HpdP49429 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HpdP49429 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HpdP49429 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HpdP49429 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HpdP49429 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HpdP49429 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HpdP49429 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms