Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PcntP48725 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PcntP48725 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PcntP48725 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PcntP48725 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PcntP48725 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PcntP48725 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PcntP48725 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PcntP48725 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PcntP48725 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PcntP48725 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PcntP48725 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PcntP48725 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PcntP48725 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PcntP48725 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PcntP48725 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PcntP48725 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PcntP48725 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PcntP48725 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PcntP48725 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PcntP48725 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PcntP48725 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PcntP48725 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PcntP48725 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PcntP48725 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PcntP48725 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PcntP48725 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PcntP48725 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PcntP48725 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PcntP48725 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PcntP48725 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PcntP48725 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PcntP48725 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PcntP48725 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PcntP48725 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PcntP48725 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PcntP48725 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PcntP48725 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PcntP48725 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PcntP48725 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PcntP48725 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PcntP48725 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PcntP48725 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PcntP48725 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PcntP48725 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PcntP48725 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PcntP48725 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PcntP48725 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PcntP48725 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PcntP48725 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PcntP48725 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PcntP48725 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PcntP48725 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PcntP48725 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PcntP48725 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PcntP48725 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PcntP48725 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PcntP48725 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PcntP48725 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PcntP48725 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PcntP48725 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PcntP48725 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PcntP48725 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PcntP48725 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PcntP48725 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PcntP48725 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PcntP48725 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PcntP48725 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PcntP48725 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PcntP48725 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PcntP48725 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PcntP48725 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PcntP48725 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PcntP48725 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PcntP48725 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PcntP48725 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PcntP48725 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PcntP48725 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PcntP48725 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PcntP48725 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PcntP48725 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PcntP48725 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PcntP48725 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PcntP48725 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PcntP48725 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PcntP48725 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PcntP48725 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PcntP48725 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PcntP48725 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PcntP48725 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PcntP48725 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PcntP48725 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PcntP48725 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PcntP48725 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PcntP48725 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PcntP48725 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PcntP48725 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PcntP48725 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PcntP48725 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PcntP48725 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms