Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli1P47806 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli1P47806 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gli1P47806 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli1P47806 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gli1P47806 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli1P47806 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gli1P47806 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli1P47806 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli1P47806 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gli1P47806 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms