Protein–RNA interactions for Protein: P47741

Tnfrsf4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf4P47741 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf4P47741 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf4P47741 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf4P47741 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfrsf4P47741 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms