Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab11bP46638 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab11bP46638 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms