Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cdkn1bP46414 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkn1bP46414 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdkn1bP46414 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkn1bP46414 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms