Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfsf4P43488 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfsf4P43488 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfsf4P43488 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfsf4P43488 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf4P43488 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnfsf4P43488 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.4 ms