Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdc2P43407 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms