Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HttP42859 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HttP42859 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HttP42859 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HttP42859 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HttP42859 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HttP42859 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HttP42859 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HttP42859 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HttP42859 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HttP42859 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HttP42859 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HttP42859 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HttP42859 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HttP42859 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HttP42859 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HttP42859 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HttP42859 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HttP42859 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HttP42859 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HttP42859 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HttP42859 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HttP42859 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HttP42859 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HttP42859 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HttP42859 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HttP42859 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HttP42859 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HttP42859 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HttP42859 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HttP42859 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HttP42859 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HttP42859 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HttP42859 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HttP42859 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HttP42859 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HttP42859 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HttP42859 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HttP42859 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HttP42859 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HttP42859 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HttP42859 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HttP42859 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HttP42859 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HttP42859 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HttP42859 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HttP42859 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HttP42859 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HttP42859 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HttP42859 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HttP42859 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HttP42859 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HttP42859 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HttP42859 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HttP42859 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HttP42859 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HttP42859 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HttP42859 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HttP42859 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HttP42859 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HttP42859 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HttP42859 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HttP42859 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HttP42859 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HttP42859 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HttP42859 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HttP42859 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HttP42859 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HttP42859 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HttP42859 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HttP42859 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HttP42859 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HttP42859 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HttP42859 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HttP42859 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HttP42859 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HttP42859 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HttP42859 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HttP42859 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HttP42859 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HttP42859 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HttP42859 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HttP42859 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HttP42859 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HttP42859 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HttP42859 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HttP42859 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HttP42859 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HttP42859 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HttP42859 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HttP42859 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HttP42859 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HttP42859 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HttP42859 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HttP42859 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HttP42859 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HttP42859 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HttP42859 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HttP42859 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HttP42859 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms