Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx2-5P42582 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx2-5P42582 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nkx2-5P42582 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx2-5P42582 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms