Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tac1P41539 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tac1P41539 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tac1P41539 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tac1P41539 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tac1P41539 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tac1P41539 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tac1P41539 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tac1P41539 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tac1P41539 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tac1P41539 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tac1P41539 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tac1P41539 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tac1P41539 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tac1P41539 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tac1P41539 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tac1P41539 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms