Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc19a1P41438 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slc19a1P41438 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc19a1P41438 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc19a1P41438 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms