Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Col18a1P39061 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Col18a1P39061 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Col18a1P39061 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Col18a1P39061 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Col18a1P39061 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Col18a1P39061 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Col18a1P39061 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Col18a1P39061 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Col18a1P39061 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Col18a1P39061 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Col18a1P39061 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Col18a1P39061 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Col18a1P39061 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Col18a1P39061 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Col18a1P39061 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col18a1P39061 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Col18a1P39061 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Col18a1P39061 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Col18a1P39061 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Col18a1P39061 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Col18a1P39061 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Col18a1P39061 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Col18a1P39061 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Col18a1P39061 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms