Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
KdrP35918 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
KdrP35918 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
KdrP35918 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
KdrP35918 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KdrP35918 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
KdrP35918 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KdrP35918 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KdrP35918 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KdrP35918 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KdrP35918 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KdrP35918 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KdrP35918 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KdrP35918 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KdrP35918 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KdrP35918 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
KdrP35918 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
KdrP35918 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KdrP35918 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KdrP35918 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KdrP35918 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KdrP35918 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KdrP35918 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KdrP35918 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KdrP35918 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KdrP35918 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KdrP35918 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KdrP35918 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KdrP35918 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
KdrP35918 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KdrP35918 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KdrP35918 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KdrP35918 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KdrP35918 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KdrP35918 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KdrP35918 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KdrP35918 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KdrP35918 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KdrP35918 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KdrP35918 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KdrP35918 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KdrP35918 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KdrP35918 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KdrP35918 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KdrP35918 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KdrP35918 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KdrP35918 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KdrP35918 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KdrP35918 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KdrP35918 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
KdrP35918 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KdrP35918 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KdrP35918 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
KdrP35918 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KdrP35918 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KdrP35918 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KdrP35918 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KdrP35918 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KdrP35918 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KdrP35918 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KdrP35918 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KdrP35918 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KdrP35918 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KdrP35918 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KdrP35918 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KdrP35918 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KdrP35918 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
KdrP35918 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
KdrP35918 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KdrP35918 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KdrP35918 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
KdrP35918 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KdrP35918 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KdrP35918 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KdrP35918 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KdrP35918 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KdrP35918 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
KdrP35918 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KdrP35918 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KdrP35918 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KdrP35918 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KdrP35918 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KdrP35918 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KdrP35918 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
KdrP35918 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KdrP35918 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KdrP35918 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KdrP35918 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KdrP35918 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KdrP35918 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KdrP35918 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KdrP35918 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KdrP35918 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KdrP35918 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KdrP35918 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KdrP35918 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
KdrP35918 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KdrP35918 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
KdrP35918 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
KdrP35918 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.4 ms