Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ddit3P35639 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddit3P35639 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ddit3P35639 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ddit3P35639 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 276.9 ms