Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab20P35295 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab20P35295 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab20P35295 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab20P35295 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab20P35295 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab20P35295 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab20P35295 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab20P35295 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab20P35295 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab20P35295 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab20P35295 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab20P35295 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab20P35295 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab20P35295 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab20P35295 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab20P35295 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab20P35295 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab20P35295 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab20P35295 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab20P35295 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab20P35295 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab20P35295 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms