Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Saa4P31532 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Saa4P31532 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Saa4P31532 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Saa4P31532 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Saa4P31532 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Saa4P31532 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Saa4P31532 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Saa4P31532 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Saa4P31532 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Saa4P31532 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Saa4P31532 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Saa4P31532 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Saa4P31532 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Saa4P31532 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Saa4P31532 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Saa4P31532 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms