Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Marcksl1P28667 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Marcksl1P28667 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Marcksl1P28667 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms