Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pde6aP27664 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pde6aP27664 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pde6aP27664 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
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